Akademický futsal je v ČR zastřešen Českou asociací univerzitního sportu (ČAUS), která je multisportovní asociací, která sdružuje zejména vysokoškolské sportovní kluby. Řídící složkou soutěží pro akademiky je v ČR Komise futsalu ČAUS. ČAUS aktivně spolupracuje s Komisí futsalu Fotbalové asociace České republiky.  

Mezinárodně je akademický futsal zastřešen Mezinárodní federací univerzitního sportu (Fédération Internationale du Sport Universitaire - FISU), Evropskou federací univerzitního sportu (European University Sports Associatio – EUSA).